Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1P11387 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1P11387 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOP1P11387 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOP1P11387 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1P11387 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1P11387 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1P11387 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1P11387 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1P11387 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1P11387 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1P11387 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TOP1P11387 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1P11387 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1P11387 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1P11387 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1P11387 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1P11387 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1P11387 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms