Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRM1P11229 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRM1P11229 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRM1P11229 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRM1P11229 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms