Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HKR1P10072 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HKR1P10072 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HKR1P10072 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HKR1P10072 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HKR1P10072 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HKR1P10072 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms