Protein–RNA interactions for Protein: P0CK96

SLC35E2B, Solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2BP0CK96 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35E2BP0CK96 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35E2BP0CK96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC35E2BP0CK96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35E2BP0CK96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms