Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACAA1P09110 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACAA1P09110 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms