Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PKHD1P08F94 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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