Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYP3A4P08684 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP3A4P08684 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms