Protein–RNA interactions for Protein: P08243

ASNS, Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing], humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASNSP08243 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ASNSP08243 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ASNSP08243 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASNSP08243 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASNSP08243 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASNSP08243 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASNSP08243 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ASNSP08243 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ASNSP08243 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ASNSP08243 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASNSP08243 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASNSP08243 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASNSP08243 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ASNSP08243 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ASNSP08243 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ASNSP08243 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ASNSP08243 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ASNSP08243 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ASNSP08243 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms