Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEFMP07197 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFMP07197 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFMP07197 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFMP07197 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFMP07197 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFMP07197 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFMP07197 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEFMP07197 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFMP07197 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFMP07197 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFMP07197 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFMP07197 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFMP07197 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFMP07197 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEFMP07197 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFMP07197 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFMP07197 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFMP07197 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFMP07197 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFMP07197 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFMP07197 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEFMP07197 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NEFMP07197 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NEFMP07197 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NEFMP07197 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NEFMP07197 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NEFMP07197 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NEFMP07197 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEFMP07197 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFMP07197 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFMP07197 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFMP07197 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFMP07197 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFMP07197 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFMP07197 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEFMP07197 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NEFMP07197 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms