Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA4P06727 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA4P06727 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA4P06727 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA4P06727 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA4P06727 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOA4P06727 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOA4P06727 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOA4P06727 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOA4P06727 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOA4P06727 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOA4P06727 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOA4P06727 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOA4P06727 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms