Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP1A1P05023 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP1A1P05023 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms