Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFNA4P05014 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFNA4P05014 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms