Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4AP04350 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB4AP04350 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB4AP04350 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms