Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRB1P04280 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRB1P04280 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRB1P04280 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRB1P04280 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRB1P04280 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRB1P04280 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRB1P04280 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRB1P04280 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRB1P04280 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB1P04280 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB1P04280 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB1P04280 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB1P04280 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB1P04280 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRB1P04280 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms