Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIPP01282 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIPP01282 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VIPP01282 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VIPP01282 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VIPP01282 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VIPP01282 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VIPP01282 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VIPP01282 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VIPP01282 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VIPP01282 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms