Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN12O95859 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN12O95859 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms