Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX58O95786 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX58O95786 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX58O95786 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX58O95786 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX58O95786 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX58O95786 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX58O95786 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX58O95786 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX58O95786 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX58O95786 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX58O95786 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX58O95786 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX58O95786 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX58O95786 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX58O95786 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX58O95786 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX58O95786 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX58O95786 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX58O95786 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX58O95786 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX58O95786 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX58O95786 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX58O95786 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX58O95786 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DDX58O95786 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX58O95786 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX58O95786 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX58O95786 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX58O95786 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX58O95786 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX58O95786 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX58O95786 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX58O95786 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX58O95786 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms