Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCNTO95613 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNTO95613 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNTO95613 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNTO95613 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNTO95613 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PCNTO95613 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCNTO95613 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCNTO95613 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNTO95613 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNTO95613 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNTO95613 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNTO95613 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCNTO95613 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCNTO95613 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCNTO95613 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCNTO95613 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PCNTO95613 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PCNTO95613 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCNTO95613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCNTO95613 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCNTO95613 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCNTO95613 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCNTO95613 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCNTO95613 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCNTO95613 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PCNTO95613 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PCNTO95613 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCNTO95613 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNTO95613 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNTO95613 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNTO95613 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNTO95613 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNTO95613 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNTO95613 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCNTO95613 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCNTO95613 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCNTO95613 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCNTO95613 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCNTO95613 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCNTO95613 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms