Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF1O95521 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF1O95521 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF1O95521 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF1O95521 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF1O95521 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF1O95521 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms