Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC24AO95486 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24AO95486 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms