Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MATN4O95460 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MATN4O95460 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN4O95460 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MATN4O95460 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MATN4O95460 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MATN4O95460 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MATN4O95460 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MATN4O95460 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MATN4O95460 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MATN4O95460 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN4O95460 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MATN4O95460 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms