Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SBF1O95248 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SBF1O95248 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SBF1O95248 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBF1O95248 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBF1O95248 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBF1O95248 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SBF1O95248 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBF1O95248 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBF1O95248 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SBF1O95248 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBF1O95248 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBF1O95248 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBF1O95248 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBF1O95248 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBF1O95248 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBF1O95248 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBF1O95248 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBF1O95248 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBF1O95248 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBF1O95248 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBF1O95248 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBF1O95248 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBF1O95248 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBF1O95248 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBF1O95248 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBF1O95248 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SBF1O95248 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBF1O95248 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBF1O95248 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SBF1O95248 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBF1O95248 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SBF1O95248 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SBF1O95248 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBF1O95248 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SBF1O95248 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SBF1O95248 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SBF1O95248 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SBF1O95248 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SBF1O95248 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SBF1O95248 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SBF1O95248 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SBF1O95248 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SBF1O95248 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SBF1O95248 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SBF1O95248 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SBF1O95248 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SBF1O95248 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SBF1O95248 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SBF1O95248 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SBF1O95248 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SBF1O95248 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SBF1O95248 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBF1O95248 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SBF1O95248 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SBF1O95248 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175 ms