Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCELO95171 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCELO95171 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCELO95171 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCELO95171 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCELO95171 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCELO95171 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCELO95171 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCELO95171 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCELO95171 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCELO95171 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCELO95171 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCELO95171 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCELO95171 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCELO95171 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCELO95171 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCELO95171 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCELO95171 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCELO95171 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCELO95171 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCELO95171 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms