Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCAF4O95104 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCAF4O95104 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms