Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFASCO94856 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFASCO94856 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFASCO94856 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NFASCO94856 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFASCO94856 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFASCO94856 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFASCO94856 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFASCO94856 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFASCO94856 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFASCO94856 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFASCO94856 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFASCO94856 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFASCO94856 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFASCO94856 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFASCO94856 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFASCO94856 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFASCO94856 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFASCO94856 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFASCO94856 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFASCO94856 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFASCO94856 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFASCO94856 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFASCO94856 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFASCO94856 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFASCO94856 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFASCO94856 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFASCO94856 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFASCO94856 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFASCO94856 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFASCO94856 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFASCO94856 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms