Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMO75781 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMO75781 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMO75781 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMO75781 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMO75781 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALMO75781 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALMO75781 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALMO75781 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALMO75781 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALMO75781 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMO75781 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMO75781 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMO75781 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMO75781 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMO75781 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALMO75781 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMO75781 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMO75781 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMO75781 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMO75781 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMO75781 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALMO75781 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMO75781 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMO75781 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALMO75781 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALMO75781 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALMO75781 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALMO75781 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms