Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKAP2O75563 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKAP2O75563 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms