Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC4O75487 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC4O75487 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC4O75487 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC4O75487 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC4O75487 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC4O75487 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC4O75487 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC4O75487 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC4O75487 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC4O75487 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC4O75487 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC4O75487 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC4O75487 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC4O75487 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC4O75487 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC4O75487 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC4O75487 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms