Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH4O75427 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms