Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG13O75143 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG13O75143 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG13O75143 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG13O75143 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG13O75143 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG13O75143 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG13O75143 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG13O75143 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG13O75143 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms