Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
DEPDC5O75140 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
DEPDC5O75140 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DEPDC5O75140 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms