Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PRAMEF10O60809 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PRAMEF10O60809 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF10O60809 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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