Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CXCL13O43927 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL13O43927 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL13O43927 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL13O43927 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL13O43927 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms