Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIF1CO43896 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIF1CO43896 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms