Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9BO43861 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9BO43861 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms