Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYT7O43581 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYT7O43581 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYT7O43581 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT7O43581 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT7O43581 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT7O43581 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT7O43581 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYT7O43581 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT7O43581 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYT7O43581 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYT7O43581 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYT7O43581 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYT7O43581 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYT7O43581 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms