Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPINT1O43278 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPINT1O43278 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPINT1O43278 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms