Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEFVO15553 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEFVO15553 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEFVO15553 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEFVO15553 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEFVO15553 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEFVO15553 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEFVO15553 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEFVO15553 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEFVO15553 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEFVO15553 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEFVO15553 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEFVO15553 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEFVO15553 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEFVO15553 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEFVO15553 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEFVO15553 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEFVO15553 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEFVO15553 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEFVO15553 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms