Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC1O15269 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC1O15269 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms