Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHB6O15197 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB6O15197 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms