Protein–RNA interactions for Protein: O15118

NPC1, Niemann-Pick C1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1O15118 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1O15118 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPC1O15118 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1O15118 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1O15118 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1O15118 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1O15118 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPC1O15118 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPC1O15118 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPC1O15118 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1O15118 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1O15118 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1O15118 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1O15118 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1O15118 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1O15118 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPC1O15118 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1O15118 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1O15118 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1O15118 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1O15118 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPC1O15118 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPC1O15118 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPC1O15118 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPC1O15118 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPC1O15118 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1O15118 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1O15118 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1O15118 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1O15118 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPC1O15118 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPC1O15118 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms