Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLGNO14967 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLGNO14967 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLGNO14967 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLGNO14967 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLGNO14967 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLGNO14967 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLGNO14967 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLGNO14967 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLGNO14967 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLGNO14967 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLGNO14967 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms