Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPEO14579 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPEO14579 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPEO14579 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPEO14579 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPEO14579 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPEO14579 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPEO14579 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPEO14579 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPEO14579 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPEO14579 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPEO14579 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPEO14579 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPEO14579 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPEO14579 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPEO14579 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPEO14579 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPEO14579 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COPEO14579 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPEO14579 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPEO14579 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPEO14579 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms