Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP2O00295 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP2O00295 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP2O00295 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP2O00295 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP2O00295 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP2O00295 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP2O00295 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP2O00295 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP2O00295 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP2O00295 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP2O00295 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP2O00295 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TULP2O00295 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP2O00295 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP2O00295 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP2O00295 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP2O00295 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP2O00295 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP2O00295 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP2O00295 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP2O00295 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP2O00295 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP2O00295 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TULP2O00295 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TULP2O00295 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms