Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFXAPO00287 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFXAPO00287 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
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