Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AP3B1O00203 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3B1O00203 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3B1O00203 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms