Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms