Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHLA1C9JL84 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms