Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN25C9JDP6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN25C9JDP6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms