Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRBOX1C9JBD0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRBOX1C9JBD0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms